Okruhy otázek ke státním zkouškám

LRR/SZZ1Z – Patofyziologie

1. Základní patofyziologické pojmy (Zdraví a nemoc, symptom, syndrom, nozologická jednotka, průběh a důsledky nemocí.)
2. Genetická podmíněnost nemocí (Nemoci podmíněné mutacemi genů, chromozomů (autozomní, heterozomní))
3. Zánět (Charakteristika zánětu, druhy zánětů, zánětové mediátory; Horečka, mechanismus vzniku, typy horečky)
4. Onkogeneza (Faktory vyvolávající nádorové onemocnění, průběh, interakce nádoru s organismem)
5. Fyziologie a patofyziologie metabolismu I (Fyziologie a patofyziologie výživy, metabolismu cukrů, tuků, bílkovin)
6. Fyziologie a patofyziologie metabolismu II (Fyziologie a patofyziologie vitamínů a jejich souvislosti. Poruchy metabolismu stopových prvků, patofyziologie volných kyslíkových radikálů)
7. Fyziologie a patofyziologie imunity  (Fyziologie a patofyziologie imunity a jejích složek, imunodeficience, imunopatologické reakce, alergie, anafylaxe, šok)
8. Fyziologie a patofyziologie stressu (Regulace stressogenních reakcí, průběh a účast jednotlivých složek stressu, důsledky stressogenních reakcí na organismus)
9. Fyziologie a patofyziologie vnitřního prostředí I (Fyziologie a patofyziologie objemové a osmotické rovnováhy a iontové rovnováhy)
10. Fyziologie a patofyziologie vnitřního prostředí II (Fyziologie a patofyziologie acidobazické rovnováhy – metabolická/respirační – acidóza/alkalóza)
11. Fyziologie a patofyziologie krve I (Fyziologie a patofyziologie leukocytů a erytrocytů)
12. Fyziologie a patofyziologie krve II (Fyziologie a patofyziologie hemostázy)
13. Fyziologie a patofyziologie kardiovaskulárního systému I (Fyziologie a patofyziologie srdce)
14. Fyziologie a patofyziologie kardiovaskulárního systému II (Fyziologie a patofyziologie cévního systému, EKG)
15. Fyziologie a patofyziologie respirace (Fyziologie a patofyziologie ventilace, difuse, perfuse, hypoxie, patofyziologie pleurální dutiny)
16. Fyziologie a patofyziologie ledvin (Nefrotický sy, akutní renální insuficience, chronické renální selhání uremický sy a jejich orgánové souvislosti)
17. Fyziologie a patofyziologie GIT I (Fyziologie a patofyziologie dutiny ústní, jícnu, žaludku a střeva)
18. Fyziologie a patofyziologie GIT II (Fyziologie a patofyziologie jater a žlučových cest a pankreatu)
19. Fyziologie a patofyziologie NS I (Fyziologie a patofyziologie periferních nervů a nervosvalové ploténky, spinální míchy. Bolest)
20. Fyziologie a patofyziologie NS II (Fyziologie a patofyziologie extrapyramidového systému)
21. Fyziologie a patofyziologie NS III (Fyziologie a patofyziologie vědomí a kognitivních funkcí, demyelinizační onemocnění. Fyziologie a patofyziologie krevního zásobení NS)
22. Fyziologie a patofyziologie endokrinního systému I (Fyziologie a patofyziologie vtahů a regulace ES. Funkce a poruchy hypofýzy)
23. Fyziologie a patofyziologie endokrinního systému II (Fyziologie a patofyziologie štítné žlázy a příštítných tělísek, kůry nadledvin)
24. Fyziologie a patofyziologie endokrinního systému III (Fyziologie a patofyziologie metabolismu cukrů (DM), Fyziologie a patofyziologie pohlavních žláz)
25. Fyziologie a patofyziologie lokomočního aparátu (Fyziologie a patofyziologie kostí a pojivové tkáně)

LRR/SZZ3Z – Klinická biochemie a toxikologie

1. Výkonnostní parametry laboratorních metod v klinické biochemii: preciznost, pravdivost, meze detekce a stanovitelnosti, linearita, nejistota měření, interference, analytická citlivost a specifita, sérové indexy
2. Základy kontroly kvality v klinické biochemii: interní kontrola kvality, metody provádění, Levey Jenningsův graf, Westgardova pravidla, principy externí kontroly kvality, P skóre, Z-skóre, způsoby porovnání analytických metod (standardizovaná metoda hlavních komponent, Bland-Altmann, Pasing-Bablok a Deming)
3. Nároky na kvalitu biochemického vyšetření z klinického hlediska: nejmenší klinicky významná změna výsledku, diagnostická senzitivita a specificita, jejich vztah, ROC křivka a její konstrukce, volba cut-off, pozitivní a negativní prediktivní hodnota.
4. Proces klinicko-biochemického vyšetření a jeho fáze: preanalytická fáze mimolaboratorní a laboratorní, sérové indexy, druhy biologického materiálu, zásady odběru biologického materiálu, vliv diety, věku, rasy a pohlaví na vybrané biochemické markery.
5. Základy standardizace a harmonizace v klinické biochemii, certifikace a akreditace klinických laboratoří, referenční meze v klinické biochemii a způsoby jejich stanovení.
6. Základy klinické enzymologie: třídění enzymů, koenzymy, jednotky, enzymy indikační a sekreční, izoenzymy, makroenzymy. Trinderova reakce a její aplikace. Klinicky významné enzymy (transferasy, fosfatasy a jiné)
7. Elektroforetické metody v klinické biochemii. Metody stanovení proteinů séru/plasmě, moči a mozkomíšním moku. Metody stanovení albuminu. Proteinový profil v séru a odchylky proteinového profilu při různých onemocněních. Proteiny alfa a beta frakce a jejich funkce.
8. Proteiny krevního séra – gamma globuliny. Klasifikace, hypo-γ-globulinémie, monoklonální a polyklonální gamapatie, kryoglobulinémie. Reaktanty akutní fáze (APRs), CRP, prokalcitonin, SAA.
9. Imunochemické metody v klinické biochemii. Pojmy antigen, hapten, příprava konjugovaných protilátek, Heidelberger-Kendallova křivka, použití enzymů HRP a AP, substráty. Heterogenní imunoeseje, problémy stanovení, homogenní enzymová imunoanalýza a nejčastěji používané enzymy. Popis metod EMIT, CEDIA, FPIA, KIMS, LOCI, CLIA. Rozdíly v principu detekce.
10. Metabolismus vody a jeho poruchy, osmolalita, metabolismus sodného kationtu a jeho poruchy. hyponatremie, hypernatremie, Renin-angiotenzin-aldosteronový systém (RAAS), antidiuretický hormon, natriuretické peptidy. Hlavní příčiny poruch osmolality, metabolismu vody, hypo- a hyper- natremie a jejich diagnostika.
11. Laboratorní vyšetření acidobazické rovnováhy a jejích poruch: základní pojmy, teorie ABR Astrup, Fencl, vyšetřované parametry měřené a dopočítané, klasifikace poruch ABR – základní, smíšené, regulační diagram ABR.
12. Metabolické poruchy ABR: metabolická acidóza diluční, hyperchloridemická, z nadbytku reziduálních aninontů (endogenních a exogenních), metabolická alkalóza koncentrační, hypochloridemická, z hypoproteinémie, jiné. Popište příčiny, diagnostický obraz a možné zásady terapie.
13. Respirační poruchy ABR: respirační acidóza, respirační alkalóza, popište možné příčiny, diagnostický obraz a vztah k dalším poruchám vnitřního prostředí.
14. Kalciumfosfátový metabolismus a jeho poruchy. Úloha parathormonu, kalcitoninu, vitaminu D3 a fibroblastového růstového faktoru 23 (FGF-23) v homeostáze vápníku a fosfátu. Hyperparathyreóza (primární, sekundární a teriární) a hypoparathyreóza. Stavba kosti, markery kostní novotvorby, markery kostní resorpce, osteomalacie.
15. Poruchy metabolismu sacharidů. Hypoglykemie při lačnění vs postprandiální, hypoglykemie u novorozenců a kojenců, hyperglykemie: Diabetes mellitus typu 1, typu 2 a těhotenský. Diagnostický algoritmus DM, nároky na preanalytickou fázi. Glykovaný hemoglobin. Komplikace diabetu, diabetická ketoacidóza, hyperosmolární kóma, diabetická nefropatie, neuropatie a retinopatie.
16. Poruchy metabolismu lipidů. Lipidy a lipoproteiny krevní plasmy a jejich třídění, přehled apoliporoteinů, enzymatické stanovení cholesterolu, volných mastných kyselin, aterogeneze a aterogenní index plasmy (AIP), aterogenní lipoprotein Lp(a). Patologie metabolismu lipidů, primární a sekundární poruchy, klasifikace dle Fredricksona, sfingolipidózy
17. Endokrinní systém, klasifikace hormonů a mechanismus účinku. Hormony vázající se na membránové receptory vs intracelulární receptory. Tkáňové hormony. 5 endokrinních os hypothalamo-hypofyzárního systému a mechanismy regulace. Hormony hypotalamu a hypofýzy. Liberiny, statiny a tropiny. TSH, FSH a LH, růstový hormon, ACTH a spojená onemocnění
18. Hormony štítné žlázy – tyroxin a kalcitonin. Syntéza a mechanismus účinku tyroxinu. Primární, sekundární a terciární hypotyreóza; hyperthyreóza – Gravesova-Basedowova nemoc a hyperfunkční struma
19. Hormony nadledvin – katecholaminy, glukokortikoidy a mineralokortikoidy. Metabolismus katecholaminů, degradace, percepce a účinek. Glukokortikoidy, hypofunkce kůry nadledvin, kongenitální hyperplazie nadledvin, Cushingova choroba a funkční testy kůry nadledvin
20. Pohlavní hormony – testosteron, progesteron a estrogeny. Transport a mechanismy regulace, anti-Mülleriánský hormon. Těhotenství a screening, placentární choriogonadotropin a laktogen, hemolytická nemoc plodu, specifický těhotenský protein A a alfa-fetoprotein
21. Laboratorní diagnostika jaterních chorob – jaterní enzymy ALT, AST, GGT a ALP, cholestáza, proteiny, diagnostika virových hepatitid A, B a C, karbohydrát deficientní transferin.
22. Bilirubin a jeho metabolismus. Konjugace, hyperbilirubinémie – příčiny, klasifikace a diagnostika. Hyperbilirubinemie novorozenců a kojenců, juvenilní hyperbilirubinémie
23. Laboratorní diagnostika chorob ledvin – metody vyšetření glomerulární filtrace, frakční exkrece, clearance bezelektrolytové vody, proteinurie, vyšetření močového sedimentu
24. Kardiální markery – enzymy, myoglobin, CK-MB mass, troponiny, natriuretické peptidy. Popište význam jednotlivých markerů vzhledem k akutnímu infarktu myokardu a chronickému srdečnímu selhávání.
25. Tumorové markery – klasifikace, klinický význam, screeningové markery FOB a PSA, ideální tumorový marker.
26. Biochemická vyšetření chorob GIT – žaludeční sekrece, Helicobacter pylori, nespecifické střevní záněty, pankreatické enzymy, FOB
27. Toxikologie těkavých látek – metanol, ethanol, ethylenglykol, toluen, vyšetřovací metody akutní intoxikace a chronického ethylismu. Popište také základní toxikokinetické a toxikodynamické vlastnosti ethanolu, rizika akutní intoxikace, chronického zneužívání a charakter závislosti.
28. Hlavní skupiny OPL I – kanabinoidy, budivé aminy. Popište základní vlastnosti skupiny OPL, rámcové toxikokinetické a toxikodynamické vlastnosti, rizika akutní intoxikace a chronického zneužívání, charakter závislosti.
29. Hlavní skupiny OPL II – opioidy, hypnotika. Popište základní vlastnosti skupin OPL, rámcové toxikokinetické a toxikodynamické vlastnosti, rizika akutní intoxikace a chronického zneužívání, charakter závislosti.
30. Vyšetřovací postupy v toxikologii – orientační a systematický průkaz návykových látek. Imunochemické metody v orientačním průkazu OPL, metody vyšetření těkavých látek, metody systematického průkazu – GC-MS, GC-MS/MS a LC-MS/MS.

LRR/SZZ4Z – Bioanalytické metody

1. Nespektrální optické metody – základní principy nespektrálních metod (rozdíl mezi spektrálními a nespektrálními metodami, změny vlastností záření – rychlost, otáčení roviny polarizovaného světla, rozptyl záření); principy polarimetrie (chiralita, optická otáčivost, využití v analýze biomolekul), nefelometrie a turbidimetrie (rozptyl světla); aplikace nespektrálních metod v klinické diagnostice(stanovení celkových bílkovin, albuminu v moči a dalších proteinů).
2. Spektrální optické metody – základní principy spektrálních metod (elektromagnetické spektrum a jeho vlastnosti – frekvence, vlnová délka, vlnočet); princip absorpční spektrometrie v UV-VIS oblasti a aplikace spektrálních metod pro stanovení biomolekul v klinické praxi – kvantitativní analýza bílkovin, semikvantitativní vyšetřování bílkovin (diagnostické proužky); vznik a využití luminiscence v bioanalytice (stanovení celkové DNA a imunoglobulinů).
3. Enzymové analytické metody – nomenklatura a klasifikace enzymů, kinetika enzymových reakcí, jednotky enzymové aktivity; metody stabilizace enzymů (přídavek solí, chemická modifikace, imobilizace); enzymy jako analytická činidla – výhody a nevýhody enzymových metod, příklady enzymových metod v klinické praxi (Wartburgův optický test, enzymy jako diagnostické markery).
4. Fyzikálně-chemické metody v enzymové analýze – princip manometrických, spektrofotometrických, fluorescenční, polarimetrických a elektrochemických metod; příklady použití – reakce katalyzované oxidoreduktázami a lyázami, stanovení laktátu a etanolu, sledování metabolismů cukrů, stanovení kyseliny močové a glukózy.
5. Biosenzory – definice, základní pojmy, přehled fyzikálně-chemických převodníků biosenzorů; jak fungují elektrochemické biosenzory, jaké jsou principy optických biosenzorů; využití biosenzorů v praxi – aplikace pro bojové otravné látky, stanovení glukózy, tkáňové elektrody, imunosenzory, aplikace biosenzorů pro detekci DNA.
6. Elektrochemické analytické metody – základní pojmy (elektroda, elektrodový děj), rozděleníelektrod, laboratorní vyšetření acidobazické rovnováhy (ABR) a iontů, aplikace v detekci a stanovení biomolekul (močoviny, glukózy, cholesterolu, laktátu).
7. Protilátky a imunochemické metody – principy analytických aplikací využívajících protilátky, kvantitativní imunoanalýza se značkou (fluorescenční, bioluminiscenční, radioaktivní, enzymová), homogenní a heterogenní imunoanalýza. Imunochromatografický test (lateral flow assay).
8. Chromatografické techniky – principy a teorie chromatografického dělení molekul, gelová permeační chromatografie, iontově-výměnná chromatografie, afinitní chromatografie a jejich využití v analýze biomolekul.
9. Instrumentální chromatografické techniky – princip plynové (GC), kapalinová chromatografie (HPLC, UHPLC) a superkritické fluidní chromatografie (SFC) a jejich využití v analýzy biomolekul.
10. Bioafinitní chromatografie – princip, nosič, ligandy, spacer, sorpce a desorpce, molekulárně vtištěné polymery.
11. Metabolomika – definice metabolomických metod, základních pojmy a význam pro biologický výzkum, přehled základních principů a používaných analytických nástrojů, dílčí kroky metabolomické analýzy (prekoncentrace, přehled a srovnání analytických metody, zpracování dat).
12. Analytika lipidů (lipidomika) – charakteristika základní lipoproteinových tříd, metody extrakce lipidů z biologických vzorků, principy plynové chromatografie (GC) a kapalinové chromatografie (LC) při analýze lipidů, hmotnostní spektrometrie v lipidomice, metody kvantitativní a kvalitativní analýzy lipidů.
13. Elektromigrační separační metody v plošném uspořádání – elektroforéza a izoelektrická fokusace na nosičích – typy nosičů, jejich charakteristiky a využití v praxi. Vizualizace separovaných látek.
14. Elektromigrační separační metody v kapilárním uspořádání – elektroosmotický tok, kapilární elektroforéza a její využití v klinické praxi a toxikologické analýze; kapilární izotachoforéza, micelární elektrokinetická chromatografie, kapilární elektrochromatografie a jejich využití v praxi.
15. Peptidové mapování (PMF) – příprava vzorků a postup identifikace proteinů, základní charakteristiky a omezení tohoto přístupu? Popište způsob interpretace získaných spekter a jejich použití pro identifikaci proteinů (vyhledávací algoritmy a databáze). Uveďte přístroje, které se u toho přístupu využívají a proč?
16. Peptidové sekvenování (PS, MS/MS) – příprava vzorků, postup identifikace peptidů a proteinů, základní charakteristiky tohoto přístupu. Popište způsob interpretace získaných spekter a jejich použití pro identifikaci proteinů (vyhledávací algoritmy a databáze). Uveďte přístroje, které se u tohoto přístupu používají a proč?
17. Fragmentace peptidů v hmotnostní spektrometrii – techniky fragmentace peptidů v hmotnostní spektrometrii (CID, ETD, ECD, SID, IRMPD, HCD); jejich principy, vlastnosti, typy iontových sérií a použití. Nomenklatura fragmentace peptidů (iontové série vs. způsob aktivace).
18. Kvantitativní proteomika – vysvětlení pojmů, obecné dělení metod pro kvantitativní proteomiku. Definice ideálního standardu pro hmotnostní spektrometrii, použití kvantitativní proteomiky. Výhody/nevýhody různých přístupů ke značení proteinů a peptidů v kvantitativní proteomice z hlediska přesnosti analýzy.
19. Dvoudimenzionální polyakrylamidová elektroforéza – vysvětlení pojmů, princip metody, uspořádání, provedení a vlastností; aplikace při analýze proteinů, výhody/nevýhody této techniky; technika DIGE, princip, výhody, provedení a použití.