Naše výzkumná skupina se zabývá vývojem a aplikací široké škály pokročilých proteomických přístupů pro analýzu komplexních biologických vzorků a studium molekulárních mechanismů v různých biologických systémech.
Tyto proteomické metody využíváme k analýze rostlinných materiálů, tkání, biologických tekutin, buněčných modelů i živočišných organismů. Zabýváme se charakterizací kvalitativních a kvantitativních změn proteomů spojených s fyziologickými a patologickými procesy, buněčnou odpovědí na stres a mechanismy účinku biologicky aktivních látek.
Součástí našeho výzkumu je vývoj metod přípravy vzorků, separačních strategií a bioinformatických postupů pro analýzu vysoce komplexních dat. Proteomická data integrujeme také s výsledky metabolomických a lipidomických analýz pro komplexnější biologickou interpretaci studovaných systémů.
K analýzám využíváme moderní LC–MS/MS instrumentaci s iontovou mobilitou a pokročilé nástroje pro zpracování, statistické vyhodnocení a biologickou interpretaci dat.
Vedoucí výzkumného programu:
Další členové:
- Ivo Chamrád
- Jaroslava Friedecká
- Hana Svobodová
- Radim Simerský (Oddělení chemické biologie)
- Natálie Zemánková