Naše výzkumné programy jsou strukturovány do individuálních týmů, které spojuje zaměření na molekulární charakterizace vývojových a adaptivních mechanismů regulovaných rostlinnými hormony. S využitím genetických a biochemických nástrojů, včetně moderních metod sekvenování nové generace, se snažíme odhalovat nové regulační mechanismy ovlivňující signální kaskády a procesy související se syntézou a transportem rostlinných metabolitů – jak prekurzorů, tak aktivních forem rostlinných hormonů.
Jedním z výzkumných témat je studium regulace cytokininové percepce v Arabidopsis prostřednictvím receptorů z rodiny AHK. Zde se uplatňuje široká škála regulačních mechanismů, které působí na transkripční úrovni, ale i na úrovni vnitrobuněčného transportu a lokalizace receptorů v buněčných kompartmentech. Další výzkumný program si klade za cíl porozumět metabolickým drahám udržujícím homeostázu fytohormonů u vzdáleně příbuzných druhů rostlin, se zaměřením zejména na nové regulační mechanismy v drahách pro auxin a kyselinu jasmonovou.
Naše týmy integrují klasické přístupy molekulární biologie s metodami buněčné biologie, s důrazem na mikroskopii v živých buňkách. Rutinně využíváme techniky exprese GFP fúzních proteinů, jakož i další metody fluorescenčního značení, ke studiu molekulárních mechanismů in situ. Modelové organismy, jako je Arabidopsis, bryofyt Physcomitrium patens a zástupce nahosemenný Picea abies, jsou v našich studiích využívány k pochopení mechanismů evoluční konzervace metabolických drah. Kromě toho využíváme několik kmenů patogenních hub ke zkoumání interakcí mezi houbovými patogeny a hostitelskými rostlinami.
Skupina disponuje základním i pokročilým přístrojovým vybavením, včetně konfokálního mikroskopu s vysokým rozlišením a růstových komor pro práci s GMO Arabidopsis rostlinami.
Vedoucí výzkumného programu:
Další členové:
- David Zalabák – cytokininová signalizace a transport
- Federica Brunoni – homeostáze rostlinných hormonů, metabolické dráhy auxinu a kyseliny jasmonové
- Jakub Hajný – auxinový transport, regulační mechanismy řízené nekódující RNA, sacharidová signalizace, percepce cytokininů
- Anita Ament, Martin Hudeček, Veronika Kábrtová, Karolína Vagaská
- Anna Kuchařová, Kateřina Perničková, Tereza Trávníčková